생정보학 논문 작성법

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 생정보학 논문의 철학, 목적, 그 파급효과 (The philosophy, purpose, and effect of bioinformatic papers)

  - Jong Bhak (박종화)


0. 생정보학에서, 논문이란 것의 정의, 순수 목적, 그 파급효과를 먼저 항상 생각해야한다.
  * 어떻게든 동료들의 지식, 능력, 경험을 활용토록, 도움이 될수 있는 많은 사람들을 끌어들이고, 잘 리드하고, 중개하면, 대부분 더 좋은 
논문을 공동으로 작성할수 있다.


생정보학 논문작성의 개별적 단계 (Bioinformatics manuscript steps)
1. 아이디어발생:
    발표를 하거나, 만나거나, 이야기하고 관심을 모으고 잡담/토론함

2. 초기작업진행
    결과를 간단히(비공식적으로, 잡담이나, 점심, 지나가다가,아니면, 관심자를 만나서) 설명하고, 비판, 문제점, 방향등에 서로 의견공유

3. 공동으로 내용을 인지하고 배움 
    토론, 이메일, 잡담을 통해, 그 문제에서 재미있는것을 서로 배우고 깨닫고 새로운문제도출, 방법론도출, 논문관련 이야기

4. 초기 초안작성(First draft)
   공동저자가 될 가능성이 있는 관련자들에게 배포하고, 기여, 저자개입등에 대해 이메일, 만나기, 발표, 토론등을 거쳐 대충의 저자윤곽, 저자들 모두가 논문의 내용을 숙지하고, 문제점, 방향등에 대해 잘알게됨

   * 이 과정이 가장 중요하고 보람있는 부분임. 연구자 자신들에게는, 이런 그룹활동을 통해 팀워크로서 새로운 문제를 배우고, 해결하고 다른 과학자들과 공유할가치있는 지식창출의 보람을 느낌.

     4.1. 공저자 결정 (deciding co-authors)
     공저자 결정시, 누구든 지위때문에, 팀장/실장/센터장이기 때문에 기여가 많지 않는데 들어가는 관행은 잘못됨. 어떤 식으로든 논문의 형성, 과정, 작성, 결과에 중요한 기여가 필요하고, 그 논문을 쓴 사람(저자)으로서의 자격이 있어야함. 공식 지도교수이기때문에, 아니면, 단순 상식적 토론을 많이하고, 업무 지시를 많이 내렸기 때문에 저자가 되는 관행도 옳지 않음. 핵심은, 점 하나까지도, 저자기여도도, 감사말까지에도 정확성고 진실하게 쓸 때 논문의 질 높아짐.

      4.2. 묵시적 압력
      만약 어떤식으로든, 상급직위, 선배, 지도교수등의 묵시적인 저자들기 압력이 있으면, 그것에 대해 원칙으로 단호히 대응해야함. 

5. 초기 초안개정 (Crude draft)
    몇 번의 초안 왔다갔다를 거쳐서, 저자들 모두가 논문을 수정, 결과기입등을 통해 최종본을 만들어 나감. 각 저자가 수정하거나, 첨부하면, 첫째, 혹은 교신저자가 중개인 역할을 하면서, 모든 글자하나, 코멘트하나하나에 동의(확인답을 들음)를 얻음. 이것은 인감도장을 찍는 사업관련 계약서를 모두 세밀히 검토하는 것 만큼의 정확하고 치밀한 협력, 토론, 확정이 필요함.

6. 최종본 작성(Final draft)
     최종본이 작성되면, 모든 저자에게 확인(서명이메일)을 받고 영어교정등의 작업

7. 제출편지작성(Cover letter)
     제출편지를 작성하여, 그 논문의 내용을 보이고, 저자의 대표로서 내용의 이상이 없는지 저자들에게 확인. 저자들이 수정/추가/확인 함

8. 제출(submission)
    제출의 목적은 자신이 잘낫고, 똑똑하고, 열심히 일한 것을 보여주기 위한 것이 아니라 정확한 지식/검정/새로운해법/발견을 공유하고, 더 같이 잘해보자는 순수한 의도가 있어야함. 
    또, 정부로부터 연구비 받은 연구자이면, 그 연구비결과를 사회에 공표, 공유해야할 기본적 (도덕적, 기술적) 책임이 있음 (특허, 논문, 발표등등)

9. 떨어짐(Rejection and revision)
     논문평을 보고, 그것의 질을 판단, 정치적인것인지, 비전문가가 헛소리를 한 것인지, 뛰어난 평가자가 자세히, 정확하게 문제를 파악하고 떨어뜨렸는지를 보고, 그것에 맞춰 수정, 보완, 재 제출, 다른 곳에 제출등을 다른 공동저자화 계속 연락하면서 진행. 

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